Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms