Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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