Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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