Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms