Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2C2-202ENST00000416219 3472 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms