Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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