Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD83Q01151 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD83Q01151 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD83Q01151 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms