Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA2P51531 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms