Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms