Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms