Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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