Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms