Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RLBP1P12271 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms