Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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