Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms