Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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