Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBASH3AP57075 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBASH3AP57075 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBASH3AP57075 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms