Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms