Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRCA2P51587 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms