Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBX2P40425 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBX2P40425 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBX2P40425 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBX2P40425 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBX2P40425 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBX2P40425 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBX2P40425 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PBX2P40425 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms