Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms