Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YY1P25490 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YY1P25490 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms