Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms