Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC42Q9Y546 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms