Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00588Q9Y4M8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms