Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms