Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM2AQ9Y2K7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM2AQ9Y2K7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms