Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HHLA3Q9XRX5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA3Q9XRX5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms