Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVW-1Q9UQF0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms