Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN8AQ9UQD0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCN8AQ9UQD0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN8AQ9UQD0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms