Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNND2Q9UQB3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms