Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC8A2Q9UPR5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1339 ms