Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM33Q9UPN9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms