Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF112Q9ULX5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF112Q9ULX5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF112Q9ULX5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms