Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FZD4Q9ULV1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FZD4Q9ULV1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms