Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP50Q9UKX7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP50Q9UKX7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms