Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms