Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNNA3Q9UI47 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNA3Q9UI47 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms