Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM10Q9UDY6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms