Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD3Q9P035 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACD3Q9P035 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms