Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV7

ZIM2, Zinc finger imprinted 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM2Q9NZV7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIM2Q9NZV7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIM2Q9NZV7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM2Q9NZV7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms