Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHD3Q9NZN3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms