Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN3Q9NZ94 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN3Q9NZ94 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms