Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSENENQ9NZ42 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSENENQ9NZ42 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms