Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIN1Q9NXP7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIN1Q9NXP7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIN1Q9NXP7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms