Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRMT1Q9NXH9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms