Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIC8BQ9NVN3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms