Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF13Q9NV06 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF13Q9NV06 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DCAF13Q9NV06 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms