Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKN1Q9NS71 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GKN1Q9NS71 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms