Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BIN3Q9NQY0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms